有两个大型的微生物家族--有益真菌和有益细菌。第一类的代表是Micorrhizal真菌。这些真菌在植物根部和土壤中的一些真菌之间以相互共生的方式工作。菌根真菌在植物根部定植,并通过外部菌丝网向它们提供从土壤中提取的矿物元素和水,而植物则向微生物提供基本的有机化合物和糖。由于菌根的作用,植物的根部表面增加了100至1000倍,从而提高了营养和水的吸收能力。
菌根是通过体内或体外技术产生的。第一种方法确保真菌在自然条件下生长,因此对土壤条件的抵抗力更强。
其他一些真菌(如毛霉菌的一些菌株)刺激植物发育,提高植物生产力。它们还能够诱导小根的形成,并刺激其他有益微生物在根际和根部的定植。
有益的细菌通过联合在根茎层内定居。它们将主要作用于植物的营养功能--特别是增加矿物质的吸收,以及更好地抵抗非生物压力。市场上提供的主要产品是根瘤菌和植物生长促进型根瘤菌。